Родился в Белоруссии. Окончил Новосибирский институт инженеров железнодорожного транспорта. Вся трудовая деятельность связана с железнодорожным транспортом, работал на Красноярской и Восточно-Сибирской железной дороге.

1975 год - стоял у истоков создания в Красноярском крае системы промышленного железнодорожного транспорта, возглавил первое объединение «Промжелдортранса», включившего в себя разрозненные транспортные цеха промышленных предприятий в Красноярском крае, Иркутской и Кемеровской областях, республики Хакасия. Глава компании успешно сочетает руководство акционерным обществом с активной общественной работой, находясь посту первого вице-президента Ассоциации "Промжелдортранс", являясь вице-президентом Союза товаропроизводителей и предпринимателей Красноярского края, а также координатором краевой трёхсторонней комиссии по регулированию социально-трудовых отношений.

Труд Лапунова Г.С. отмечен высокими государственными, отраслевыми и общественными наградами, среди которых два ордена Трудового Красного Знамени, орден Октябрьской революции, медали «За трудовое отличие», «За доблестный труд». Генеральный директор АО «В-Сибпромтранс» удостоен званий «Заслуженный работник транспорта России», «Почетный железнодорожник», «Почетный работник транспорта России», «Почетный работник промышленного железнодорожного транспорта», награжден знаком отличия «За заслуги перед г. Красноярском», знаком «Признание» Законодательного Собрания Красноярского края. Трижды завоевывал звание «Лучший менеджер России», был удостоен премии им. Петра Великого, Золотой медали Наполеона французской ассоциации SPI, дипломов Президента ТПП РФ и премии «Золотая Колесница» в номинации «Руководитель года транспортной отрасли», Золотого ордена МВФ «Меценат» и др. Лапунов Г.С. В марте 2017 года Геннадию Семеновичу была вручена Благодарность Президента РФ, а в 2019 году награжден почетным знаком «85 лет Красноярскому краю».